Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms