Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3H9

5530401A14Rik, RIKEN cDNA 5530401A14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530401A14RikQ9D3H9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms