Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf128Q9D304 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf128Q9D304 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.8 ms