Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Spns3Q9D232 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms