Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Mrpl28Q9D1B9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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