Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shmt2Q9CZN7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms