Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Pfdn1Q9CWM4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Pfdn1Q9CWM4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pfdn1Q9CWM4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Pfdn1Q9CWM4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn1Q9CWM4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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