Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms