Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930550L24RikQ99PA7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930550L24RikQ99PA7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms