Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsnaxip1Q99P25 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms