Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcgf6Q99NA9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms