Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd6Q99JI4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd6Q99JI4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd6Q99JI4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd6Q99JI4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd6Q99JI4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmd6Q99JI4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd6Q99JI4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms