Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Def8Q99J78 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms