Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms