Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W5

Tsen15, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen15Q8R3W5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsen15Q8R3W5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsen15Q8R3W5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms