Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmpQ8R373 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms