Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms