Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms