Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms