Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RybpQ8CCI5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms