Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms