Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933409G03RikQ8C5U0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933409G03RikQ8C5U0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933409G03RikQ8C5U0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms