Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf2Q8C176 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf2Q8C176 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms