Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SprnQ8BWU1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SprnQ8BWU1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms