Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms