Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd3Q6ZQK0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms