Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssx9Q6XAS3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ssx9Q6XAS3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssx9Q6XAS3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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