Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85bQ6PDY0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms