Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms