Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms