Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rftn1Q6A0D4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms