Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc2Q69ZB8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms