Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8eQ66JT1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms