Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PtprdQ64487 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprdQ64487 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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