Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f3Q63955 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms