Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lcn3Q62471 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lcn3Q62471 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lcn3Q62471 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lcn3Q62471 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lcn3Q62471 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lcn3Q62471 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lcn3Q62471 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn3Q62471 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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