Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox17Q61473 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms