Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms