Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761185Q5ERI8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms