Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr18Q4VBE8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms