Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap1Q3UUV5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms