Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1lQ3USQ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms