Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl2Q3UMU9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms