Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dcaf17Q3TUL7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms