Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms