Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccbe1Q3MI99 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms