Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdss2Q33DR3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss2Q33DR3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms