Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms