Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb8Q0VBD0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms