Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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SYCNQ0VAF6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SYCNQ0VAF6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SYCNQ0VAF6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SYCNQ0VAF6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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